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基于密度感知模式的生物序列分類算法

大小:0.87 MB 人氣: 2018-03-29 需要積分:1

  針對現有的基于模式的序列分類算法對于生物序列存在分類精度不理想、模型訓練時間長的問題,提出密度感知模式,并設計了基于密度感知模式的生物序列分類算法-BSC。首先,在生物序列中挖掘具有“密度感知”的頻繁序列模式;然后,對挖掘出的頻繁序列模式進行篩選、排序制定成分類規則;最后,通過分類規則對沒有分類的序列進行分類預測。在4組真實生物序列中進行實驗,分析了BSC算法參數對結果的影響并提供了推薦參數設置;同時分類結果表明,相比其他四種基于模式的分類算法,BSC算法在實驗數據集上的準確率至少提高了2.03個百分點。結果表明,BSC算法有較高的生物序列分類精度和執行效率。

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