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研究人員將研發(fā)出能夠結(jié)合氮素固定能力細(xì)菌來結(jié)束人工化肥的時(shí)代

yrlT_lianggezhi ? 2017-12-22 09:18 ? 次閱讀

在過去的 100 年里,自從德國化學(xué)家 Fritz Haber 和 Carl Bosch 發(fā)現(xiàn)從空氣中強(qiáng)行提取氮肥的方法后,農(nóng)民就一直在依賴這種并不完美的產(chǎn)品幫助作物生長。

這種制造化肥的方法擁有眾多缺點(diǎn):生產(chǎn)過程每年消耗全球天然氣 3% 的使用量,向大氣中排放大量的溫室氣體,還造成水資源污染。這種依賴化石燃料生產(chǎn)化肥來生產(chǎn)食物的方法并不是可持續(xù)發(fā)展的。但是,要在全球變暖不斷惡化的情況下解決 90 億人的溫飽問題,這也實(shí)屬無奈之舉。

一種解決方法是在人類的飲食結(jié)構(gòu)中加入大量的豆科植物。花生、豌豆等的豆科植物能夠?yàn)樽陨碇圃旎剩圆粫?huì)對氣候造成破壞。

豆科植物可以作為一種叫做氮素固定者的細(xì)菌的寄主。這些細(xì)菌會(huì)侵入植物的根毛并形成結(jié)點(diǎn)狀結(jié)構(gòu),來將土壤中豐富的氮元素轉(zhuǎn)化為氨。植物會(huì)利用這些氨進(jìn)行光合作用生產(chǎn)養(yǎng)料。然而,目前世界上的主要農(nóng)作物(如玉米、大麥、水稻等)都不能作為氮素固定者的合適寄主。這就是為什么這些作物需要大量的人造化肥的原因。

圖丨表面涂有特殊細(xì)菌的玉米種子能夠防止植物根部被蟲蛀。

解決這一問題還有另一種方法,那就是研制出一種不僅擁有強(qiáng)大的氮素固定能力,還能夠在任何植物的根部生長的細(xì)菌。這樣一來,我們就能夠?qū)⑦@種細(xì)菌涂抹在擁有無限保質(zhì)期的種子上并發(fā)售到世界上任何地方。

這就是一家農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新企業(yè)的計(jì)劃。這家企業(yè)宣稱將對農(nóng)作物種子的相關(guān)技術(shù)開展在截至目前同類企業(yè)中最大的投資。上周四,德國生化產(chǎn)業(yè)巨頭拜爾(Bayer)宣布將與來自波士頓的生物科技初創(chuàng)公司 Ginkgo Bioworks 合作,共同創(chuàng)立一家新公司以試圖結(jié)束人工化肥的時(shí)代。

新公司的臨時(shí) CEO、拜爾作物科技集團(tuán)(Bayer Crop Science)生物部總管 Mike Miile 表示:“我們知道這些氮素固定者細(xì)菌能夠?yàn)橹参飵砣斯せ仕鶡o法滿足的好處。但是,由于這種細(xì)菌進(jìn)化的結(jié)果,它們只能夠結(jié)合到特定植物的根部。我們正在研究如何解決這個(gè)問題。”

新公司(目前還并沒有名字)將會(huì)在 Ginkgo 即將竣工的全自動(dòng) DNA 車間以及拜爾作物科技集團(tuán)(Bayer Crop Science)在西薩克拉門托的研發(fā)中心進(jìn)行合作研究。拜爾公司的科研團(tuán)隊(duì)已經(jīng)開始了對其擁有的細(xì)菌庫進(jìn)行檢索來篩選出適合這種任務(wù)的細(xì)菌來寄給波士頓的實(shí)驗(yàn)室。在成百上千的細(xì)菌中,科研人員希望能夠選擇出多樣化的眾多氮素固定者使 Ginkgo 的研究人員能夠最早在下個(gè)月前開始研究。

這種篩查工作能夠讓研究人員找出哪個(gè)基因是氮素固定的主要影響因素。然而,由于研究人員沒有土壤中細(xì)菌的染色體圖譜作為參考,這樣的過程將會(huì)十分困難。不過,一旦這種篩查成功,研究人員將會(huì)利用這些基因來設(shè)計(jì)并合成 DNA 來生產(chǎn)新的細(xì)菌供研究人員進(jìn)一步探索。

最終,研究人員將研發(fā)出一種能夠結(jié)合氮素固定能力與種子表面吸附能力的細(xì)菌。這種細(xì)菌需要符合眾多標(biāo)準(zhǔn):能夠離開水存活很久,并在種子重新接觸水時(shí)再次活躍;能夠在培養(yǎng)皿中生長(大部分自然中的氮素固定細(xì)菌都沒有這種特點(diǎn));還需要能夠被批量化生產(chǎn)。

圖丨在 Ginkgo 位于波士頓的 DNA 工坊中,機(jī)器人正在根據(jù)基因篩選特殊的細(xì)菌。

利用初始的 1 億美元資金,以及目前最先進(jìn)的 DNA 合成機(jī)器人,這個(gè)公司希望在接下來的 5 年之內(nèi)在西薩克拉門托的農(nóng)田中播種帶有氮素固定者細(xì)菌涂層的。

但是,要實(shí)現(xiàn)這樣的計(jì)劃是困難重重。其中的一點(diǎn)原因是氮素固定是一個(gè)十分復(fù)雜的過程。在將氮素轉(zhuǎn)化為氨的過程中,至少有 20 個(gè)基因與這個(gè)過程利用的蛋白質(zhì)直接相關(guān),而與其中新陳代謝過程間接相關(guān)的蛋白質(zhì)還需要牽扯到更多的基因。總之,要重建這種自然中最基本的生化過程是一項(xiàng)巨大的挑戰(zhàn)。

即使研究人員成功重建了這種過程,要在現(xiàn)實(shí)世界中實(shí)現(xiàn)這種細(xì)菌的應(yīng)用是十分困難的。研究人員對于發(fā)芽的種子周圍的環(huán)境(叫做spermosphere)的知識(shí)十分有限:我們并不知道生長中的植物所產(chǎn)生的糖分、酶以及細(xì)菌對周圍土壤的影響。

總而言之,豆科植物與寄生的氮素固定者細(xì)菌之間的關(guān)系是數(shù)百萬年來進(jìn)化的結(jié)果。我們對其他植物如水稻、小麥以及玉米等是否也能夠產(chǎn)生這種關(guān)系一無所知。Ginkgo 公司的合伙創(chuàng)始人以及首席執(zhí)行官 Jason Kelly 表示:“我們在這方面知識(shí)不足將成為我們需要克服的主要挑戰(zhàn)之一。但是,植物對氮素的需求正是這種寄生關(guān)系產(chǎn)生的重要推動(dòng)原因之一。生物進(jìn)化的趨勢必然有利于實(shí)現(xiàn)我們的目標(biāo)。”我們很有可能在不久的將來見到這項(xiàng)技術(shù)為我們所帶來的效益。


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原文標(biāo)題:科學(xué)家將開發(fā)出定制細(xì)菌,幫助人類結(jié)束人造化肥時(shí)代

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