得益于大數(shù)據(jù)的興起和計算能力的快速提升,機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)近年來經(jīng)歷了革命性的發(fā)展。諸如圖像分類、語音識別和自然語言處理等機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù),都是對具有一定大小、維度和有序排列的歐幾里得數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。然而,在許多現(xiàn)實場景中,數(shù)據(jù)是由復(fù)雜的非歐幾里得數(shù)據(jù)(例如圖形)表示的。這些圖形不僅包含數(shù)據(jù),還包含數(shù)據(jù)之間的依賴關(guān)系,例如社交網(wǎng)絡(luò)、蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)、電子商務(wù)平臺中的客戶數(shù)據(jù)等。數(shù)據(jù)復(fù)雜性的提升給傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)算法設(shè)計及其實現(xiàn)技術(shù)帶來了嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。在這種情況下,許多全新的基于圖形的機(jī)器學(xué)習(xí)算法或圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(GNN)不斷在學(xué)術(shù)界和工業(yè)界涌現(xiàn)。
GNN對計算能力和存儲有非常高的要求,而且其算法的軟件實現(xiàn)效率非常低。因此,業(yè)界對GNN的硬件加速有著非常迫切的需求。盡管傳統(tǒng)的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)硬件加速有很多種解決方案,但GNN的硬件加速還沒有得到充分的討論和研究。在撰寫本白皮書時,谷歌(Google)和百度(Baidu)都無法搜索到關(guān)于GNN硬件加速的中文研究資料。本白皮書的寫作動機(jī)是將國外最新的GNN算法、對加速技術(shù)的研究以及對基于現(xiàn)場可編程邏輯門陣列(FPGA)的GNN加速技術(shù)的探討相結(jié)合,并以概述的形式呈現(xiàn)給讀者。
對圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(GNN)的介紹
在宏觀層面上,GNN的架構(gòu)與傳統(tǒng)CNN有很多相似之處,諸如卷積層、池化、激活函數(shù)、機(jī)器學(xué)習(xí)處理器(MLP)、全連接層(FC layer)等模塊,這些都可以應(yīng)用到GNN。下圖展示了一個相對簡單的GNN架構(gòu)。
圖1:典型的GNN架構(gòu)(來源:https://arxiv.org/abs/1901.00596)
但是,GNN中的圖形數(shù)據(jù)卷積計算與傳統(tǒng)CNN中的二維卷積計算不同。以下圖為例,紅色目標(biāo)節(jié)點的卷積計算過程如下所示:
1、圖卷積 - 使用近鄰函數(shù)對周圍節(jié)點的特征進(jìn)行采樣,并計算平均值。相鄰節(jié)點的數(shù)量是不確定且無序的(非歐幾里得數(shù)據(jù))
2、二維卷積——使用卷積核對周圍節(jié)點的特征進(jìn)行采樣,并計算加權(quán)平均值。相鄰節(jié)點的數(shù)量是確定且有序的(歐幾里得數(shù)據(jù))
圖2:圖卷積和二維卷積(來源:https://arxiv.org/abs/1901.00596)
對GraphSAGE算法的介紹
學(xué)術(shù)界對GNN算法進(jìn)行了大量的研究和探討,提出了相當(dāng)多的創(chuàng)新實現(xiàn)方法。其中,由斯坦福大學(xué)(Stanford University)于2017年提出的GraphSAGE是一種歸納表示學(xué)習(xí)算法,用于預(yù)測大規(guī)模圖中動態(tài)的、全新的、未知的節(jié)點類型,還專門針對節(jié)點數(shù)量龐大、節(jié)點特征豐富的圖進(jìn)行了優(yōu)化。如下圖所示,GraphSAGE算法的計算過程可以分為三個主要步驟:
1、相鄰節(jié)點采樣——用于降低復(fù)雜性,一般采樣兩層,每層采樣幾個節(jié)點。
2、聚合——用于嵌入目標(biāo)節(jié)點,即圖的低維向量表示。
3、預(yù)測——使用嵌入作為全連接層的輸入,以預(yù)測目標(biāo)節(jié)點d的標(biāo)簽。
圖3:GraphSAGE算法的可視化表示(來源:http://snap.stanford.edu/graphsage)
1、樣本鄰域
2、聚合來自鄰域的特征信息
3、利用聚合信息預(yù)測圖形情況和標(biāo)簽
為了在FPGA中實現(xiàn)GraphSAGE算法加速,必須了解其數(shù)學(xué)模型,以便將算法映射到不同的邏輯模塊。下圖所示的代碼說明了該算法的數(shù)學(xué)過程。
圖4:GraphSAGE算法的數(shù)學(xué)模型(來源:http://snap.stanford.edu/graphsage)
步驟1:使用近鄰函數(shù)N[}對子圖節(jié)點進(jìn)行采樣。
步驟2:聚合相鄰節(jié)點的特征,例如mean[}、lstm[}、polling[}
步驟3:合并聚合的節(jié)點特征。例如卷積[}
步驟4:非線性激活,例如relu[}
步驟5:使用子圖迭代每個鄰域
步驟6:標(biāo)準(zhǔn)化
步驟7:對每個深度搜索進(jìn)行迭代
步驟8:節(jié)點v的最終節(jié)點嵌入
對于每個要處理的目標(biāo)節(jié)點xv,GraphSAGE算法都會執(zhí)行以下操作:
1、通過近鄰采樣函數(shù)N(v)對子圖中的節(jié)點進(jìn)行采樣。
2、聚合要采樣的相鄰節(jié)點的特征。聚合函數(shù)可以是mean()、lstm()或polling()等。
3、將聚合結(jié)果與上一次迭代的輸出表示合并起來,并使用Wk進(jìn)行卷積。
4、對卷積結(jié)果進(jìn)行非線性處理。
5、多次迭代以結(jié)束當(dāng)前第k層的所有相鄰節(jié)點的處理。
6、對第k層迭代的結(jié)果進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理。
7、多次迭代以結(jié)束對所有K層采樣深度的處理。
8、將最終的迭代結(jié)果zv嵌入到輸入節(jié)點xv。
GNN加速器設(shè)計所面臨的挑戰(zhàn)
GNN算法涉及大量的矩陣計算和存儲訪問操作。在傳統(tǒng)的x86架構(gòu)服務(wù)器上運行這種算法的效率是非常低的,表現(xiàn)為速度慢、能耗高等。
新型圖形處理器(GPU)的應(yīng)用可以顯著提高GNN的計算速度與能效比。但是,GPU在存儲可擴(kuò)展性方面存在短板,使其無法處理圖形中的海量節(jié)點。GPU的指令執(zhí)行方式也會導(dǎo)致計算延遲過大和不確定性;因此,它不適用于需要實時計算圖形的場景。
上面提到的各種設(shè)計挑戰(zhàn),使得業(yè)界迫切需要一種能夠支持高并發(fā)、實時計算,擁有巨大存儲容量和帶寬,并可擴(kuò)展到數(shù)據(jù)中心的GNN加速解決方案。
基于FPGA設(shè)計方案的GNN加速器
Achronix的Speedster?7t系列FPGA產(chǎn)品(以及該系列的第一款器件AC7t1500)是針對數(shù)據(jù)中心和機(jī)器學(xué)習(xí)工作負(fù)載進(jìn)行了優(yōu)化的高性能FPGA器件,消除了基于中央處理器(CPU)、GPU和傳統(tǒng)FPGA的解決方案中存在的若干性能瓶頸。Speedster7t系列FPGA產(chǎn)品采用了臺積電(TSMC)的7nm FinFET工藝,其架構(gòu)采用了一種革命性的全新二維片上網(wǎng)絡(luò)(NoC)、獨創(chuàng)的機(jī)器學(xué)習(xí)處理器矩陣(MLP),并采用高帶寬GDDR6控制器、400G以太網(wǎng)和PCI Express Gen5接口,在確保ASIC級性能的同時,它為用戶提供了靈活的硬件可編程性。
下圖展示了高性能FPGA器件Speedster7t1500的架構(gòu)。
圖5:Achronix高性能FPGA器件SpeedsterAC7t1500的架構(gòu)
上述特點使Achronix Speedster7t1500器件成為應(yīng)對在GNN加速器設(shè)計中面臨的各種挑戰(zhàn)的完美解決方案。
表1:GNN設(shè)計面臨的挑戰(zhàn)和Achronix Speedster7t1500 FPGA器件提供的解決方案
GNN設(shè)計所面臨的挑戰(zhàn) | Speedster AC7t1500器件提供的解決方案 |
高速矩陣運算 | 機(jī)器學(xué)習(xí)處理器(MLP) |
高帶寬和低延遲存儲 | LRAM+BRAM+GDDR6+DDR4。 |
高并發(fā)和低延遲計算 | FPGA使用可編程邏輯電路,以確保在硬件層面進(jìn)行低并發(fā)和高并發(fā)延遲計算。 |
存儲擴(kuò)展 | 基于4×400 Gbps的RDMA確保在數(shù)據(jù)中心以極低的延遲擴(kuò)展存儲訪問。 |
算法不斷演進(jìn) | FPGA中的可編程邏輯確保算法可以在硬件層面進(jìn)行升級和重新配置。 |
復(fù)雜的設(shè)計 | 豐富的硬IP減少開發(fā)時間、降低復(fù)雜性,NoC簡化模塊之間的互連并改善時序 |
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原文標(biāo)題:白皮書:一種基于FPGA的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)加速器解決方案(WP024)(第一部分)
文章出處:【微信號:Achronix,微信公眾號:Achronix】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。
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一種基于FPGA的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)加速器解決方案

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