前面的文章中介紹過，每一個PCIe設備可以只有一個功能（Function），即Fun0。也可以擁有最多8個功能，即多功能設備（Multi-Fun）。不管這個PCIe設備擁有多少個功能，其每一個功能都有一個唯一獨立的配置空間（Configuration Space）與之對應。

和PCI總線一樣，PCIe總線中的每一個功能（Function）都有一個唯一的標識符與之對應。這個標識符就是BDF（Bus，Device，Function），PCIe的配置軟件（即Root的應用層，一般是PC）應當有能力識別整個PCIe總線系統的拓撲邏輯，以及其中的每一條總線（Bus），每一個設備（Device）和每一項功能（Function）。

在BDF中，Bus Number占用8位，Device Number占用5位，Function Number占用3位。顯然，PCIe總線最多支持256個子總線，每個子總線最多支持32個設備，每個設備最多支持8個功能。

PCIe總線采用的是一種深度優先（Depth First Search）的拓撲算法，且Bus0總是分配給Root Complex。Root中包含有集成的Endpoint和多個端口（Port），每個端口內部都有一個虛擬的PCI-to-PCI橋（P2P），并且這個橋也應有設備號和功能號。

需要注意的是，每個設備必須要有功能0（Fun0），其他的7個功能（Fun1~Fun7）都是可選的。

一個簡單的例子如下圖所示：

注：關于PCIe總線的拓撲邏輯會在后面的文章中進行詳細地介紹。

前面的關于PCI總線的文章介紹過PCI總線的配置空間，PCIe總線為了兼容這些PCI設備，幾乎完整的保留了PCI總線的配置空間。并將配置空間擴展到4KB，用于支持一些PCIe總線中新的功能，如PCI Express Capability、Power Management和MSI/MSI-X等。

下圖是從PCI總線中繼承過來的配置空間：

下圖是PCIe新增的配置空間的示意圖：